Ano, Peppol podporuje samofakturaci. Podle specifikací Peppol BIS 3.0 je samofakturace v rámci Peppol povolena, pokud proces fakturace splňuje pravidla a omezení stanovená v evropské normě EN 16931. Při samofakturaci vystavuje fakturu kupující, nikoli dodavatel, a tento proces může být podporován prostřednictvím infrastruktury Peppol pro elektronickou výměnu dokumentů.

Další podrobnosti najdete v oficiální dokumentaci Peppol zde.